Взрослые самцы достигают длины до 45 см, тогда как самки значительно меньше — всего до 20 см. В остальном половой диморфизм выражен слабо: самцы и самки практически неотличимы, за исключением размеров. Характерной чертой этого вида является форма тела, напоминающая лезвие ножа, что и дало ему название. У рыбы отсутствует спинной плавник, а хвостовой плавник преобразован в рудиментарный орган. При этом анальный плавник тянется вдоль всего тела, и именно благодаря его волнообразным движениям Эйгенманния зеленая перемещается, умело двигаясь как вперёд, так и назад. Рыба полупрозрачна, поэтому выраженной окраски у неё нет. Уникальность ей придаёт особый орган, генерирующий слабое электромагнитное поле, которое помогает ей ориентироваться в пространстве и находить пищу при плохой видимости.