Para el mantenimiento cómodo de un pequeño cardumen de Moenkhausia agnesae, se necesitará un acuario de al menos 100 litros. En la decoración del acuario es deseable utilizar abundante vegetación, dejando suficiente espacio libre para nadar. La elección del sustrato no es crítica, pero un sustrato oscuro ayudará a que la coloración de los peces sea más expresiva. Es importante mantener los parámetros del agua con valores bajos de pH y dH, y la temperatura no debe ser inferior a 25°C. Se recomienda añadir troncos naturales y hojas secas de algunos árboles, ya que liberan taninos, creando condiciones cercanas a las naturales. El cuidado del acuario incluye procedimientos estándar: cambio parcial semanal de agua, limpieza de residuos orgánicos (alimento no consumido, excrementos) y revisión regular del equipo.