El Hypancistrus zebra a menudo desova en acuarios domésticos, por lo que, si se dan las condiciones adecuadas, la aparición de alevines es solo cuestión de tiempo. Para controlar el inicio del período de apareamiento y garantizar la supervivencia de la descendencia, se puede utilizar un acuario de cría. Por lo general, es un tanque pequeño de 30 litros o más. En su diseño, los refugios son cruciales y pueden formarse con pequeñas macetas de cerámica colocadas de lado, trozos de tuberías de PVC o elementos decorativos especiales que imitan grutas y cuevas submarinas. La abertura de entrada debe ser solo un poco más ancha que el pez. El refugio se coloca cerca de los difusores de aire para asegurar un alto nivel de oxígeno y circulación del agua. No se requieren plantas ni sustrato en el acuario de cría. Los parámetros del agua, como el pH, dGH y la temperatura, deben coincidir con los del acuario principal. Un estímulo para el desove es la renovación del agua (50-70% del volumen) con agua fresca y 2-4°C más fría, lo que imita la temporada de lluvias en la naturaleza. Este procedimiento se repite cada 2-3 días. Después de un tiempo, los peces gato entrarán en el período de apareamiento. Los machos, habiendo elegido un refugio adecuado, comenzarán a invitar a las hembras. Una vez que la pareja se une, se aíslan durante varios días. Luego, la hembra se va y el macho se queda para proteger y cuidar la puesta. Generalmente se depositan de 7 a 15 huevos. Los alevines eclosionan después de una semana, y después de otros 2-3 días, salen del refugio y comienzan a nadar libremente. Después de este momento, el macho puede ser devuelto al acuario comunitario. Los alevines deben ser alimentados con alimentos especializados para alevines de peces de acuario, así como nauplios de artemia, microgusanos y productos similares. Los alevines son muy voraces, por lo que el acceso a la comida debe ser constante.