El pez arcoíris del lago Sentani se caracteriza por las enfermedades típicas de la familia Melanotaeniidae, que surgen cuando se violan las condiciones de mantenimiento. Los peces son sensibles a la calidad del agua, por lo que la acumulación de desechos orgánicos y los altos niveles de amoníaco o nitritos provocan rápidamente infecciones bacterianas, que se manifiestan como erosión de las aletas, úlceras o turbidez de las membranas mucosas. Además, bajo estrés causado por fluctuaciones bruscas de los parámetros o superpoblación, la especie es susceptible a la ictioftiriasis (puntos blancos en el cuerpo) y a las infecciones fúngicas. La prevención de enfermedades consiste en mantener parámetros de agua estables y cambios regulares. Un peligro particular es la tendencia de la especie a la hibridación con otros miembros del género, lo que, en una cría incontrolada, debilita la inmunidad de la descendencia y conduce a la degeneración de la población. Para preservar la salud de los peces, se recomienda evitar mantenerlos en el mismo acuario con especies estrechamente relacionadas, ya que esto no solo conduce a la pérdida de la pureza de la línea, sino que también dificulta el diagnóstico de condiciones específicas de la especie debido a la similitud externa de los individuos.